Atlas blev grundlagt i 1916 og er en af de ældste fodboldklubber i Mexico. Atlas spiller deres hjemmekampe på Estadio Jalisco, som ligger i Guadalajara. Stadionet har en betydningsfuld historie i mexicansk fodbold og har været vært for adskillige vigtige kampe, herunder VM-kampe. Atlas' traditionelle hjemmebanedragt har en rød og en sort halvdel. Atlas har en hård lokal rivalisering med Chivas de Guadalajara, kendt som "Clásico Tapatío". Kampe mellem Atlas og Chivas er blandt de mest intense og forventede kampe i mexicansk fodbold.